පොලිපෙප්ටයිඩ පෙප්ටයිඩ දාමයේ සැලසුම් යෝජනා ක්රමය සහ විසඳුම

I. සාරාංශය
පෙප්ටයිඩ යනු විශේෂ සාර්ව අණු වන අතර ඒවායේ අනුපිළිවෙල ඒවායේ රසායනික හා භෞතික ලක්ෂණ වල අසාමාන්‍ය වේ.සමහර පෙප්ටයිඩ සංස්ලේෂණය කිරීමට අපහසු වන අතර අනෙක් ඒවා සංශ්ලේෂණය කිරීමට සාපේක්ෂව පහසු නමුත් පිරිසිදු කිරීමට අපහසු වේ.ප්‍රායෝගික ගැටළුව නම් බොහෝ පෙප්ටයිඩ ජලීය ද්‍රාවණවල තරමක් ද්‍රාව්‍ය වන බැවින් අපගේ පිරිසිදු කිරීමේදී ජලභීතික පෙප්ටයිඩයේ අනුරූප කොටස ජලීය නොවන ද්‍රාවකවල දිය කළ යුතුය, එබැවින් මෙම ද්‍රාවක හෝ බෆර භාවිතයට දැඩි ලෙස නොගැලපේ. ජීව විද්‍යාත්මක පර්යේෂණ ක්‍රියා පටිපාටි, කාර්මික ශිල්පීන්ට ඔවුන්ගේම අරමුණු සඳහා පෙප්ටයිඩ භාවිතා කිරීම සපුරා තහනම් වන පරිදි, පර්යේෂකයන් සඳහා පෙප්ටයිඩ නිර්මාණය කිරීමේ අංශ කිහිපයක් පහත දැක්වේ.

පොලිපෙප්ටයිඩ පෙප්ටයිඩ දාමයේ සැලසුම් යෝජනා ක්රමය සහ විසඳුම
දෙවනුව, කෘතිම දුෂ්කර පෙප්ටයිඩවල නිවැරදි තේරීම
1. පහත් නියාමනය කරන ලද අනුපිළිවෙලෙහි සම්පූර්ණ දිග
පෙප්ටයිඩයේ ප්‍රමාණය වැඩි වන අතර බොරතෙල් නිෂ්පාදනයේ සංශුද්ධතාවය අඩු වන නිසා අපද්‍රව්‍ය 15 ට අඩු පෙප්ටයිඩ ලබා ගැනීම පහසුය.පෙප්ටයිඩ දාමයේ මුළු දිග අපද්‍රව්‍ය 20කින් ඔබ්බට වැඩි වන බැවින්, නිශ්චිත නිෂ්පාදන ප්‍රමාණය ප්‍රධාන සැලකිල්ලක් වේ.බොහෝ අත්හදා බැලීම් වලදී, අවශේෂ අංකය 20 ට වඩා අඩු කිරීමෙන් අනපේක්ෂිත බලපෑම් ලබා ගැනීම පහසුය.
2. ජලභීතික අපද්‍රව්‍ය ගණන අඩු කරන්න
ජලභීතික අපද්‍රව්‍ය විශාල ප්‍රමුඛතාවයක් සහිත පෙප්ටයිඩ, විශේෂයෙන් සී-ටර්මිනස් සිට 7-12 අවශේෂ කලාපයේ, සාමාන්‍යයෙන් කෘතිම දුෂ්කරතා ඇති කරයි.සංශ්ලේෂණයේදී B-fold ෂීට් ලබා ගැනීම නිසා මෙය ප්‍රමාණවත් නොවන සංයෝජනයක් ලෙස පෙනේ."එවැනි අවස්ථා වලදී, ධනාත්මක හා සෘණ අපද්‍රව්‍ය දෙකකට වඩා පරිවර්තනය කිරීම හෝ පෙප්ටයිඩ සංයුතිය අගුළු හැරීම සඳහා Gly හෝ Pro පෙප්ටයිඩයට දැමීම ප්‍රයෝජනවත් විය හැක."
3. "දුෂ්කර" අපද්‍රව්‍ය අඩු කිරීම
"සාමාන්‍යයෙන් පහසුවෙන් සංස්ලේෂණය නොකරන Cys, Met, Arg සහ Try ශේෂයන් ගණනාවක් තිබේ."Ser සාමාන්යයෙන් Cys සඳහා ඔක්සිකාරක නොවන විකල්පයක් ලෙස භාවිතා කරනු ඇත.
පොලිපෙප්ටයිඩ පෙප්ටයිඩ දාමයේ සැලසුම් යෝජනා ක්රමය සහ විසඳුම

තෙවනුව, ජලයේ දියවන නිවැරදි තේරීම වැඩි දියුණු කරන්න
1. N හෝ C පර්යන්තය සකස් කරන්න
ආම්ලික පෙප්ටයිඩ වලට සාපේක්ෂව (එනම් pH 7 හි සෘණ ආරෝපණය වේ), ඇසිටිලේෂන් (N-terminus acetylation,C terminus සෑම විටම නිදහස් කාබොක්සිල් කාණ්ඩයක් පවත්වා ගෙන යයි) සෘණ ආරෝපණය වැඩි කිරීමට විශේෂයෙන් නිර්දේශ කෙරේ.කෙසේ වෙතත්, මූලික පෙප්ටයිඩ සඳහා (එනම්, pH අගය 7 දී ධන ආරෝපිත), amination (N-terminus හි නිදහස් ඇමයිනෝ කාණ්ඩය සහ C-terminus හි amination) ධන ආරෝපණය වැඩි කිරීමට විශේෂයෙන් නිර්දේශ කෙරේ.

2. අනුපිළිවෙල විශාල ලෙස කෙටි කිරීම හෝ දිගු කිරීම

සමහර අනුපිළිවෙලවල් වල Trp, Phe, Val, Ile, Leu, Met, Tyr සහ Ala වැනි හයිඩ්‍රොෆෝබික් ඇමයිනෝ අම්ල විශාල ප්‍රමාණයක් අඩංගු වේ. මෙම ජලභීතික අපද්‍රව්‍ය 50% ඉක්මවන විට, ඒවා සාමාන්‍යයෙන් දිය කිරීම පහසු නොවේ.පෙප්ටයිඩයේ ධනාත්මක සහ සෘණ ධ්‍රැව තවදුරටත් වැඩි කිරීම සඳහා අනුපිළිවෙල දිගු කිරීම ප්‍රයෝජනවත් විය හැකිය.දෙවන විකල්පය වන්නේ හයිඩ්‍රොෆෝබික් අපද්‍රව්‍ය අඩු කිරීම මගින් ධන හා සෘණ ධ්‍රැව වැඩි කිරීම සඳහා පෙප්ටයිඩ දාමයේ ප්‍රමාණය අඩු කිරීමයි.පෙප්ටයිඩ දාමයේ ධනාත්මක සහ සෘණ පැති ශක්තිමත් වන තරමට එය ජලය සමඟ ප්‍රතික්‍රියා කිරීමට ඇති ඉඩකඩ වැඩිය.
3. ජලයේ ද්‍රාව්‍ය අවශේෂයක් දමන්න
සමහර පෙප්ටයිඩ දාම සඳහා, සමහර ධනාත්මක සහ සෘණ ඇමයිනෝ අම්ල සංයෝගයක් ජල ද්‍රාව්‍යතාව වැඩි දියුණු කළ හැක.අපගේ සමාගම Glu-Glu සමඟ ඒකාබද්ධ කිරීමට ආම්ලික පෙප්ටයිඩවල N-terminus හෝ C-terminus නිර්දේශ කරයි.මූලික පෙප්ටයිඩයේ N හෝ C පර්යන්තය ලබා දී පසුව Lys-Lys.ආරෝපිත කණ්ඩායම තැබිය නොහැකි නම්, Ser-Gly-Ser N හෝ C පර්යන්තයේ ද තැබිය හැකිය.කෙසේ වෙතත්, පෙප්ටයිඩ දාමයේ පැති වෙනස් කළ නොහැකි විට මෙම ප්රවේශය ක්රියා නොකරයි.