ට්‍රාන්ස්මෙම්බ්‍රේන් පෙප්ටයිඩවල ව්‍යුහාත්මක ලක්ෂණ සහ වර්ගීකරණය

ට්‍රාන්ස්මෙම්බ්‍රේන් පෙප්ටයිඩ වර්ග බොහොමයක් ඇති අතර ඒවායේ වර්ගීකරණය භෞතික හා රසායනික ගුණ, ප්‍රභවයන්, ශරීරගත කිරීමේ යාන්ත්‍රණ සහ ජෛව වෛද්‍ය යෙදුම් මත පදනම් වේ.ඒවායේ භෞතික හා රසායනික ගුණාංග අනුව, පටල විනිවිද යන පෙප්ටයිඩ වර්ග තුනකට බෙදිය හැකිය: කැටානික්, ඇම්ෆිෆිලික් සහ හයිඩ්‍රොෆෝබික්.කැටානික් සහ ඇම්ෆිෆිලික් පටල විනිවිද යන පෙප්ටයිඩ 85% ක් වන අතර හයිඩ්‍රොෆෝබික් පටල විනිවිද යන පෙප්ටයිඩ 15% ක් පමණි.

1. කැටානික් පටලය විනිවිද යන පෙප්ටයිඩ

කැටානික් ට්‍රාන්ස්මෙම්බ්‍රේන් පෙප්ටයිඩ TAT, Penetratin, Polyarginine, P22N, DPV3 සහ DPV6 වැනි ආර්ජිනින්, ලයිසීන් සහ හිස්ටයිඩින් වලින් පොහොසත් කෙටි පෙප්ටයිඩ වලින් සමන්විත වේ.ඔවුන් අතර, arginine සෛල පටලය මත සෘණ ආරෝපිත පොස්පරික් අම්ල කාණ්ඩ සමග හයිඩ්රජන් බන්ධන හා කායික PH අගය තත්ත්වය යටතේ පටල බවට transmembrane peptides මැදිහත් විය හැකි guanidine, අඩංගු වේ.ඔලිගාජිනින් (3 R සිට 12 R දක්වා) අධ්‍යයනයෙන් පෙන්නුම් කළේ පටල විනිවිද යාමේ හැකියාව ලබා ගත හැක්කේ ආර්ජිනින් ප්‍රමාණය 8 ක් තරම් අඩු වූ විට පමණක් වන අතර ආර්ජිනින් ප්‍රමාණය වැඩි වීමත් සමඟ පටල විනිවිද යාමේ හැකියාව ක්‍රමයෙන් වැඩි විය.ලයිසීන්, ආර්ජිනීන් වැනි කැටානික වුවද, ගුවානයිඩින් අඩංගු නොවේ, එබැවින් එය තනිවම පවතින විට, එහි පටල විනිවිද යාමේ කාර්යක්ෂමතාව ඉතා ඉහළ නොවේ.Futaki et al.(2001) හොඳ පටල විනිවිද යාමේ බලපෑමක් ලබා ගත හැක්කේ කැටායන සෛල පටල විනිවිද යන පෙප්ටයිඩයේ අවම වශයෙන් ධන ආරෝපිත ඇමයිනෝ අම්ල 8ක් අඩංගු වූ විට පමණක් බව සොයා ගන්නා ලදී.විනිවිද පෙප්ටයිඩ පටලයට විනිවිද යාමට ධන ආරෝපිත ඇමයිනෝ අම්ල අපද්‍රව්‍ය අත්‍යවශ්‍ය වුවද, අනෙකුත් ඇමයිනෝ අම්ල සමානව වැදගත් වේ, එනම් W14 F බවට විකෘති වන විට, Penetratin හි විනිවිද යාමේ හැකියාව නැති වේ.

කැටායන ට්‍රාන්ස්මෙම්බ්‍රේන් පෙප්ටයිඩවල විශේෂ පන්තියක් වන්නේ න්‍යෂ්ටික ස්ථානගත කිරීමේ අනුපිළිවෙලවල් (NLSs) වන අතර එය ආර්ජිනින්, ලයිසීන් සහ ප්‍රෝලීන් වලින් පොහොසත් කෙටි පෙප්ටයිඩ වලින් සමන්විත වන අතර න්‍යෂ්ටික සිදුරු සංකීර්ණය හරහා න්‍යෂ්ටිය වෙත ප්‍රවාහනය කළ හැකිය.NLS තවදුරටත් මූලික ඇමයිනෝ අම්ල පොකුරු එකකින් සහ දෙකකින් සමන්විත තනි සහ ද්විත්ව ටයිප් කිරීම ලෙස බෙදිය හැකිය.උදාහරණයක් ලෙස, simian virus 40(SV40) වෙතින් PKKKRKV තනි ටයිප් කරන NLS වන අතර න්‍යෂ්ටික ප්‍රෝටීන ද්විත්ව ටයිප් කරන NLS වේ.KRPAATKKAGQAKKKL යනු පටල ට්‍රාන්ස්මෙම්බ්‍රේනයේ කාර්යභාරයක් ඉටු කළ හැකි කෙටි අනුපිළිවෙලයි.බොහෝ NLS වල ආරෝපණ අංක 8 ට වඩා අඩු බැවින්, NLSs ඵලදායි ට්‍රාන්ස්මෙම්බ්‍රේන් පෙප්ටයිඩ නොවේ, නමුත් ඇම්ෆිෆිලික් ට්‍රාන්ස්මෙම්බ්‍රේන් පෙප්ටයිඩ සෑදීමට හයිඩ්‍රොෆෝබික් පෙප්ටයිඩ අනුපිළිවෙලට සහසංයුජව සම්බන්ධ කළ විට ඒවා ඵලදායි ට්‍රාන්ස්මෙම්බ්‍රේන් පෙප්ටයිඩ විය හැක.

ව්යුහාත්මක-2

2. ඇම්ෆිෆිලික් ට්‍රාන්ස්මෙම්බ්‍රේන් පෙප්ටයිඩ

ඇම්ෆිෆිලික් ට්‍රාන්ස්මෙම්බ්‍රේන් පෙප්ටයිඩ හයිඩ්‍රොෆිලික් සහ හයිඩ්‍රොෆෝබික් වසම් වලින් සමන්විත වන අතර ඒවා ප්‍රාථමික ඇම්ෆිෆිලික්, ද්විතියික α-හෙලික් ඇම්ෆිෆිලික්, β-ෆෝල්ඩින් ඇම්ෆිෆිලික් සහ ප්‍රෝලින්-සපෝෂිත ඇම්ෆිෆිලික් ලෙස බෙදිය හැකිය.

MPG (GLAFLGFLGAAGSTMGAWSQPKKKRKV) සහ Pep - 1 (KETWWETWTWTEWTEWKVKV) වැනි ප්‍රාථමික වර්ගයේ ඇම්ෆිෆිලික් වෙයාර් පටල පෙප්ටයිඩ කාණ්ඩ දෙකකට, න්‍යෂ්ටිකකරණය මත පදනම් වූ Pep - 1 (KETWWETWKREWKVKVKV) යන දෙකම, හයිඩ්‍රොෆෝබික් පෙප්ටයිඩ අනුක්‍රමය මගින් සහසංයුජ සම්බන්ධිත NLS සහිත කාණ්ඩයකි. එහි ජලභීතිකාව MPG හි වසම HIV glycoprotein 41 (GALFLGFLGAAGSTMG A) හි විලයන අනුපිළිවෙලට සම්බන්ධ වන අතර Pep-1 හි ජලභීතික වසම ඉහළ පටල සම්බන්ධතාවයක් සහිත (KETWWET WWTEW) ට්‍රිප්ටෝෆාන් පොහොසත් පොකුරට සම්බන්ධ වේ.කෙසේ වෙතත්, දෙකෙහිම ජලභීතික වසම් WSQP හරහා PKKKRKV න්‍යෂ්ටික ස්ථානගත කිරීමේ සංඥාව සමඟ සම්බන්ධ වේ.ප්‍රාථමික ඇම්ෆිෆිලික් ට්‍රාන්ස්මෙම්බ්‍රේන් පෙප්ටයිඩවල තවත් පන්තියක් pVEC, ARF(1-22) සහ BPrPr(1-28) වැනි ස්වභාවික ප්‍රෝටීන වලින් හුදකලා විය.

ද්විතියික α-helical amphiphilic transmembrane peptides α-helices හරහා පටලයට බන්ධනය වන අතර, ඒවායේ ජලභීතික සහ හයිඩ්‍රොෆොබික් ඇමයිනෝ අම්ල අපද්‍රව්‍ය MAP (KLALKLALK ALKAALKLA) වැනි හෙලික්සීය ව්‍යුහයේ විවිධ පෘෂ්ඨ මත පිහිටා ඇත.බීටා පෙප්ටයිඩ නැමීමේ ආකාරයේ ඇම්ෆිෆිලික් ඇඳුම් පටලය සඳහා, බීටා ප්ලීටඩ් පත්‍රයක් සෑදීමේ හැකියාව එහි පටලයට විනිවිද යාමේ හැකියාවට තීරණාත්මක වේ, උදාහරණයක් ලෙස VT5 (DPKGDPKGVTVTVTVTVTGKGDPKPD) වැනි විනිවිද යාමේ හැකියාව පිළිබඳ පර්යේෂණ කිරීමේ ක්‍රියාවලියේදී. - ඇමයිනෝ අම්ල විකෘති ඇනලොග් වලට බීටා නැමුණු කැබැල්ලක් සෑදිය නොහැක, පටලයේ විනිවිද යාමේ හැකියාව ඉතා දුර්වල ය.ප්‍රෝලීන්-සපෝෂිත ඇම්ෆිෆිලික් ට්‍රාන්ස්මෙම්බ්‍රේන් පෙප්ටයිඩවල, පොලිපෙප්ටයිඩ ව්‍යුහය තුළ ප්‍රෝලීන් අධික ලෙස පොහොසත් වූ විට පිරිසිදු ජලයේ පොලිප්‍රොලීන් II (PPII) පහසුවෙන් සෑදේ.PPII යනු වාරයකට ඇමයිනෝ අම්ල අවශේෂ 3.6 ක් සහිත සම්මත දකුණු අත ඇල්ෆා-හෙලික්ස් ව්‍යුහයට ප්‍රතිවිරුද්ධව, වාරයකට ඇමයිනෝ අම්ල ශේෂ 3.0 ක් සහිත වම් අත හෙලික්සයකි.ප්‍රෝලීන්-සපෝෂිත ඇම්ෆිෆිලික් ට්‍රාන්ස්මෙම්බ්‍රේන් පෙප්ටයිඩවලට ගව ප්‍රති-ක්ෂුද්‍ර ජීවී පෙප්ටයිඩ 7(Bac7), සින්තටික් පොලිපෙප්ටයිඩ (PPR)n(n 3, 4, 5 සහ 6 විය හැක) ආදිය ඇතුළත් විය.

ව්යුහාත්මක-3

3. හයිඩ්‍රොෆෝබික් පටලය විනිවිද යන පෙප්ටයිඩ

හයිඩ්‍රොෆෝබික් ට්‍රාන්ස්මෙම්බ්‍රේන් පෙප්ටයිඩවල අඩංගු වන්නේ ධ්‍රැවීය නොවන ඇමයිනෝ අම්ල අපද්‍රව්‍ය පමණක් වන අතර ශුද්ධ ආරෝපණය ඇමයිනෝ අම්ල අනුක්‍රමයේ සම්පූර්ණ ආරෝපණයෙන් 20% ට වඩා අඩු වේ, නැතහොත් ට්‍රාන්ස්මෙම්බ්‍රේන් සඳහා අත්‍යවශ්‍ය හයිඩ්‍රොෆෝබික් කොටස් හෝ රසායනික කණ්ඩායම් අඩංගු වේ.මෙම සෙලියුලර් ට්‍රාන්ස්මෙම්බ්‍රේන් පෙප්ටයිඩ බොහෝ විට නොසලකා හරිනු ලැබුවද, ෆයිබ්‍රොබ්ලාස්ට් වර්ධක සාධකය (K-FGF) සහ Kaposi's sarcoma වෙතින් fibroblast growth factor 12(F-GF12) වැනි ඒවා පවතී.


පසු කාලය: මාර්තු-19-2023